11/05/2018 - Desvendando a dinâmica de sistemas biológicos: novos modelos estatísticos para redes genéticas de séries temporais e experimentos genéticos de transmissão de doenças - Palestrante: Osvaldo Anacleto (ICMC–USP)

Seminário Conjunto UFSCar/ICMC

Data e horário: 11/05/2018 às 14h

Local:  Sala 43 do DEs-UFSCar

Título: Desvendando a dinâmica de sistemas biológicos: novos modelos estatísticos para redes genéticas de séries temporais e experimentos genéticos de transmissão de doenças

Palestrante: Osvaldo Anacleto, ICMC–USP

Resumo: Apesar de processos biológicos serem inerentemente dinâmicos, existe uma escassez de métodos estatísticos adequados para a análise de séries temporais genéticas. Por exemplo, poucos métodos permitem a estimação de redes de expressão gênica que capturam relações temporais entre genes. Outro exemplo se refere à estimação de efeitos genéticos influentes em surtos epidêmicos: modelos utilizados em genética quantitativa ignoram a dinâmica do processo de infecção, dificultando assim a estimação da variação genética em infectividade, que é a propensão individual a transmitir doenças.
Neste seminário serão discutidos dois métodos recentes para esses problemas relevantes em estatística genética. Primeiramente será apresentado o Modelo Dinâmico de Grafos de Cadeia. Este modelo Bayesiano decompõe problemas de estimação em séries temporais de alta dimensão em um conjunto de modelos de dimensões menores. Utilizando séries temporais genéticas de animais e plantas, será mostrado como este modelo facilita a identificação de redes que incorporam a dinâmica da expressão gênica. Em seguida, será apresentado o Modelo Dinâmico Não-Linear de Efeitos Genéticos Indiretos (dnIGE), adequado para dados de tempos de infecção coletados ou inferidos durante uma epidemia. O modelo dnIGE assume que tempos de infecção seguem processos individuais de Poisson não homogêneos, com termos de fragilidade bivariados para a infectividade e a resistência de animais a serem infectados. Será mostrado como este modelo pode estimar com acurácia a variação genética e ambiental nessas importantes características epidemiológicas. Também será apresentado um experimento genético de infecção em larga escala, recentemente finalizado em uma população de peixes, cuja análise estatística resulta na primeira evidência de variação genética na transmissão de doenças.